| 遺跡名称 | 地方 | 都道府県 | 種類 | 時代 |
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| 沖田遺跡 | 九州・沖縄 | 長崎県 | 遺物包含地 |
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| 沖ノ島遺跡 | 九州・沖縄 | 長崎県 | 遺物包含地 |
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| 千里ヶ浜遺跡 | 九州・沖縄 | 長崎県 | 遺物包含地 |
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| 朝鮮井戸海岸遺跡 | 九州・沖縄 | 長崎県 | 遺物包含地 |
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| 西加藤遺跡 | 九州・沖縄 | 長崎県 | 遺物包含地 |
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| 夫婦石遺跡 | 九州・沖縄 | 長崎県 | 遺物包含地 |
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| 堂崎遺跡 | 九州・沖縄 | 長崎県 | 遺物包含地 |
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| 大板部島洞穴遺跡 | 九州・沖縄 | 長崎県 | 貝塚 |
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| 江湖貝塚 | 九州・沖縄 | 長崎県 | 貝塚 |
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| 鷹島海底遺跡 | 九州・沖縄 | 長崎県 |
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| 名切遺跡 | 九州・沖縄 | 長崎県 | 遺物包含地 |
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| 大柳遺跡 | 九州・沖縄 | 長崎県 | 遺物包含地 |
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| 松崎遺跡 | 九州・沖縄 | 長崎県 | 遺物包含地 |
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| 串山ミルメ浦遺跡 | 九州・沖縄 | 長崎県 | 貝塚、遺物包含地 |
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| 褥崎遺跡 | 九州・沖縄 | 長崎県 |
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| 船ノ村池遺跡 | 九州・沖縄 | 長崎県 |
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| 歌ヶ浦遺跡 | 九州・沖縄 | 長崎県 |
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| 板ノ崎遺跡 | 九州・沖縄 | 長崎県 |
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| 瀬尻島南遺跡 | 九州・沖縄 | 長崎県 |
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| 瀬尻島北遺跡 | 九州・沖縄 | 長崎県 |
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| 黒崎遺跡 | 九州・沖縄 | 長崎県 |
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| 迎遺跡 | 九州・沖縄 | 長崎県 |
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| ガタ脇遺跡 | 九州・沖縄 | 長崎県 |
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| 関里遺跡 | 九州・沖縄 | 長崎県 |
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| 下り松遺跡 | 九州・沖縄 | 長崎県 |
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